После дерзкого побега из адского панамского заключения Сонта братья Майкл Скофилд и Линкольн Берроуз полны решимости добиться справедливости в противостоянии с Компанией — тайной организацией, ответственной за разрушение их судеб и смерть женщины, которую любил Майкл, доктора Сары Танкреди. Желание мести ведет Майкла в Лос-Анджелес, где его жизнь кардинально меняется после известия о том, что Сара жива. Понимая теперь возможность свободы, братья дают клятву найти Сару и уничтожить Компанию. С поддержкой агента внутренней безопасности Дона Селфа они собирают команду союзников и знакомых лиц для реализации своего плана: к ним присоединяются Махонни, Сукре, Беллок и компьютерный гений Роланд Гленн. Однако судьба братьев складывается так, что им приходится не только уклоняться от убийцы Компании Уайетта, но и искать Ти-Бэга. В итоге Майкл и Линкольн осознают, что самое сложное после побега — это взломать систему защиты.
