Сразу же после событий первого сезона, когда Степан вернулся в наше время, туда также попадает казак-предатель Назар. Он утаскивает обратно в XVII век Марию, новую подругу Степана. Вооружившись всеми возможными современными устройствами и гаджетами, Степан вновь отправляется в прошлое с целью вернуть девушку, попадая при этом прямо в водоворот исторических событий того времени, когда на престол был избран первый царь из династии Романовых — Михаил Фёдорович, ровесник Степана. Теперь Степану предстоит не только спасти Марию, но и защитить весь род Романовых от возможных опасностей. В то же время казаки оказываются в современной России и предпринимают попытки завладеть шапкой Мономаха.