Шестой сезон начинается через 20 месяцев после пятого сезона и разворачивается в течение последних одиннадцати недель до Дня шестого. За это время Соединенные Штаты подверглись серии самоубийственных терактов от побережья до побережья. Мужчина по имени Абу Файед соглашается сообщить местоположение Хамри Аль-Асада, предполагаемого организатора террористических атак, в обмен на бывшего агента контртеррористического подразделения Джека Бауэра, с которым его связывают личные счеты.
