Пятый сезон разворачивается через восемнадцать месяцев после событий четвёртого сезона. Бывший агент контртеррористического подразделения Джек Бауэр начинает этот сезон, работая обычным рабочим на нефтеперерабатывающем заводе под псевдонимом «Фрэнк Флинн» в городе Мохаве, штат Калифорния. В знаменательный день президентства Чарльза Логана готовится подписание антитеррористического договора с президентом России Юрием Суворовым, но события принимают трагический оборот.
