«Секретные материалы» были закрыты, и Малдер с Скалли оказались разлучены. Скалли обнаружила себя преподающей курсы в Академии ФБР в Куантико, штат Вирджиния, тогда как Малдеру была поручена задача слежки. В качестве его нового партнера выступал агент Алекс Крэйчек, а загадочная X стала новым источником информации для него. Малдер боролся за то, чтобы сохранить свое стремление к истине живым.
Однако ирония судьбы заключалась в том, что именно Скалли пережила те самые близкие встречи с необъяснимым, о которых так мечтал Малдер. Она отправилась в путешествие, которое в итоге воссоединило двух агентов и укрепило их связь до такой степени, что они стали ближе друг другу, чем когда-либо прежде.
