Сергей Глухарёв, уже имеющий звание майора, занимает должность начальника следственного отдела, сталкиваясь с множеством новых служебных задач и проблем. Его товарищ по службе Денис Антошин напротив погружается в сложности личного характера. Как обычно, они могут рассчитывать только на поддержку друг друга. В сериале мы наблюдаем развитие отношений Сергея не только с его подчинёнными, но и с начальницей Ириной Зиминой, а также следим за перипетиями любви Дениса к своей девушке Насте. Не менее значительные изменения происходят в жизни Николая Тарасова. Неожиданно раскрывается характер начальника СКМ Стаса Карпова, демонстрируя его многогранность и сложность. «Глухарь 3» — это правдивое отражение реальной жизни, такое же, каким каждый из нас её видит.
