Это повесть о двух братьях. Старший из них, Линкольн Барроуз, молодой человек сомнительной репутации, пребывает в заключении строгого режима тюрьмы «Фокс Ривер», ожидая смертной казни по обвинению в убийстве брата вице-президента, которое он не совершал. Младший брат, Майкл Скофилд, полон решимости спасти своего старшего родственника и организовать побег из этого учреждения. Для осуществления задуманного плана Майкл инициирует фальшивое ограбление банка, отказывается от помощи адвоката и добровольно отправляется за решетку, где его ожидает казнь для Линкольна. В прошлом Майкл работал в компании, занимавшейся реконструкцией объекта «Фокс Ривер», что позволяет ему знать множество интересных нюансов о каждом помещении тюрьмы. Вся необходимая информация всегда находится при нем, поскольку перед тем как оказаться на тюремных нарах, он сделал себе впечатляющую татуировку с подробным планом всех помещений.
Пока Майкл трудится над реализацией своего плана внутри стен тюрьмы, знакомясь с влиятельными заключенными и готовя побег века, подруга детства братьев — адвокат Вероника Доннован — проводит собственное расследование убийства брата вице-президента. Она стремится выяснить истинные мотивы подставы Линкольна и определить тех, кто стоит за серией связанных убийств.