Двадцать два года спустя после исчезновения своего отца, Ватару Курэнай живет в печально известном "доме с привидениями", где ему суждено стать Камен Райдером Кивой и сражаться с монстрами-пожирателями жизни, известными как Фангиры – расой, против которой его отец сражался до своего исчезновения. Помимо этой борьбы, Ватару сталкивается с Камен Райдером Иксой, который является частью организации, стремящейся уничтожить угрозу Фангиров, а также собственным Камену Райдеру Фангира — Каменом Райдером Сагой. Сюжет разворачивается между действиями Ватару в настоящем (2008-2009 годы) и его отца Отой в прошлом (1986-1987 годы), постепенно раскрывая связь между расой Фангиров и Кивой.